北交所基本规则构成了其服务创新型中小企业的核心制度框架，平衡市场活力、价格发现效率与必要的风险控制。这些规则主要涵盖上市准入、交易机制、投资者适当性管理以及持续监管与退市等多个维度，体现了与主板、创业板和科创板市场的差异化定位。其核心业务规则包括北京证券交易所股票上市规则（试行）、北京证券交易所交易规则（试行）和北京证券交易所会员管理规则（试行），这些规则构建了公司监管、证券交易和会员管理的基本制度基础。规则设计既遵循证券交易所制度建设的普遍规律，又充分考虑了北交所服务创新型中小企业的市场地位，形成了契合中小企业特点的差异化安排。
北交所规则具有鲜明特点。交易实行价格涨跌幅限制，日常交易的涨跌幅限制设定为百分之三十，这为市场提供了充分的价格博弈空间。新股上市首日则不设涨跌幅限制，但设有临时停牌机制作为风险缓冲，当盘中成交价格较开盘价首次上涨或下跌达到或超过百分之三十或百分之六十时，将实施盘中临时停牌，复牌时通过集合竞价方式撮合。交易申报的最低数量为一百股，但每笔申报可以一股为单位递增，这为投资者提供了更高的交易灵活性。在连续竞价期间，规则还设置了申报有效价格范围，对限价申报设定基准价格上下一定百分比的范围，并对市价申报采取限价保护措施，以防止异常报价和交易价格的剧烈波动。
参与北交所市场交易需要满足特定的投资者适当性要求。对于个人投资者而言，申请开通交易权限前需要满足两大核心条件：一是申请权限开通前二十个交易日内，证券账户和资金账户内的资产日均不低于人民币五十万元，该计算不包括投资者通过融资融券融入的资金和证券；二是具备两年以上的证券交易经验。这两项要求确保参与市场的投资者具备相应的风险承受能力和市场认知。机构投资者参与则不受上述资产门槛的限制。已开通新三板精选层交易权限的投资者，其权限将自动平移至北交所，无需额外操作。
北交所的交易方式多样，以满足不同投资者的需求。主要交易方式包括竞价交易、大宗交易等。竞价交易是主要方式，其中交易时间分为开盘集合竞价、连续竞价和收盘集合竞价阶段。对于大宗交易，规则设定了单笔申报数量或成交金额的最低门槛，当单笔申报数量不低于十万股或成交金额不低于一百万元时，可以进行大宗交易。规则还为未来引入做市机制、实行混合交易预留了制度空间。
北交所规则强调优化公司治理并强化信息披露。规则增加了独立董事应当发表意见的情形，并明确了资金占用等违规行为的监管要求。在停复牌管理上，贯彻少停、短停、分阶段停的原则，严格压缩停牌时间，例如筹划重大资产重组等事项的停牌时间有明确上限，以保障市场交易的连续性和投资者交易权利。区别于以往的主办券商终身持续督导制，北交所要求保荐机构在规定期限内履行持续督导职责，之后更多依靠公司自治。退市机制是市场健康运行的关键，北交所制定了包括交易类、财务类、规范类和重大违法类等多元化的退市标准，其中财务类退市的考察期设定相对审慎，以避免因企业短期业绩波动导致误判。
