新三板不在传统意义上的沪深交易所交易，而是通过全国中小企业股份转让系统进行股份转让。作为我国多层次资本市场体系的重要组成部分，新三板为众多中小企业提供了融资渠道和股份流通平台。这个独立于沪深交易所之外的全国性证券交易场所，由全国中小企业股份转让系统有限责任公司负责运营管理，其交易机制与主板市场存在显著差异，主要采用协议转让、做市转让等灵活方式满足不同企业的需求。
全国中小企业股份转让系统采用独特的交易制度设计，既不同于主板的连续竞价，也区别于老三板的单一集合竞价。协议转让允许买卖双方自主协商价格，通过股转系统完成股份交割；做市转让则由具备资质的证券公司提供双向报价，为市场注入流动性。新三板实施分层管理，基础层和创新层企业适用差异化的交易规则，其中基础层股票采用盘中集合竞价与做市混合模式，而创新层已引入连续竞价机制，这种精细化安排有效提升了市场运行效率。
投资者参与新三板交易需要满足严格的适当性要求。根据监管规定，个人投资者需具备两年以上证券投资经验，且基础层、创新层分别要求开通权限前10个交易日日均资产不低于200万和100万元。这种较高的准入门槛匹配市场风险特征，保护中小投资者权益。交易过程中，投资者需通过具有代办股份转让业务资格的证券公司进行操作，包括账户开立、委托申报等环节，整个流程虽然较主板复杂，但能确保交易合规性。
新三板主要服务于创新型、创业型和成长型中小微企业，填补了区域性股权市场与沪深交易所之间的空白。挂牌企业虽然无需满足上市公司的盈利标准，但仍需履行信息披露义务，包括定期公布经审计的财务报告和重大事项临时公告。这种相对宽松的准入与适度的监管要求相结合，既降低了中小企业的融资成本，又保持了必要的市场透明度，形成了区别于主板市场的特色化服务体系。
资本市场改革的深化，新三板与北京证券交易所形成了基础层-创新层-北交所的递进发展格局。这种有机联动机制为优质企业提供了上升通道，同时也为投资者创造了跨市场投资机会。需要特别说明的是，新三板作为场外交易市场，其流动性、估值水平与交易所市场存在天然差异，投资者应当充分认识这种特性，建立与风险承受能力相匹配的投资策略。
